在这番充分的说理后，周恩来话锋一转，严厉批驳高岛益郎关于战争赔偿的说法。他说:“你们条约局局长上午在外长会谈中的发言，我认为不是田中、大平先生的本意。说蒋介石已在日台条约中宣布放弃要求赔偿的权利，所以这次联合声明中就不必再提赔偿问题了。这个说法使我们感到诧异。当时蒋介石已逃到台湾，他已不能代表全中国，是慷他人之慨，遭受战争损失的主要在大陆。我们放弃赔偿要求，是从两国人民的友好关系出发，不要使日本人民因为赔偿负担而受苦。你们条约局局长对我们不领情，反而说蒋介石已说过不要赔偿，这个话是对我们的侮辱，我们绝对不能接受。日本外务省的条约局局长居然说出这种话来，使我们感到吃惊。我们在复交三原则的基础上照顾日本政府的困难，日本也应该照顾我们的立场。”
周恩来的话入情入理，简明扼要地阐明了中国政府的立场。田中对此表示完全理解。在周恩来发言后，田中立即说:“我明白了。中国把恩怨置之度外，从大处着眼，本着互谅互让的精神处理问题，日本应坦率地评价中国的立场。
关于如何表述两国间结束战争状态，也是会谈中的焦点问题。双方提供的草案中，对这个问题的表述还有较大距离。中方草案的表述是:“中华人民共和国与日本之间的战争状态自本声明公布之日起宣告结束。”日方草案的表述是:“日本国政府和中华人民共和国政府在此确认，日本国和中国间的战争状态已经结束。”
这一表述的潜台词是，这个问题在日台条约中已经解决，此次只是确认而已。
由于我们认为日台条约是“非法的、无效的”，因此对日方的表述难以接受。周恩来在第一次会谈中曾要两国外长动动脑子，想出一句双方都能接受的话。两国外长主持的声明起草小组再三斟酌，也没有找到令双方满意的措辞。在这种情况下，周恩来说:让我考虑考虑。经过一番考虑，周恩来用“不正常状态”来代替原来正文中 “战争状态”。这个建议使中日双方都感到满意。
会谈中，田中还含蓄地表示，日本有一部分人有一种疑虑，担心像中国这样的大国会不会输出革命。对此，周恩来明确表示:中国不会输出革命，也绝不会称霸。
两国外长根据两国首脑会谈的精神，主持联合声明起草小组，就有关分歧问题紧锣密鼓地协商联合声明的具体措辞。到9月27日下午，中日双方在几个主要的问题上都达成了一致，剩下的只是一些技术性的问题了。
